Samantha López Clinton


Evolutionary biologist

About


(Para versión en español, vea abajo)

Hi! 

My name is Samantha (my pronouns are she/her) and I'm an Evolutionary Biology MSc student at Uppsala University, Sweden, where I form part of the research group led by professor Katerina Guschanski. I'm currently developing an in situ genotyping tool to individually identify saddleback and emperor tamarins using non-invasive samples and the MinION portable sequencer. Both Dr. Guschanski and Dr. Mrinalini Watsa are supervising this project.

In 2015, while studying my Biology BSc degree in Mexico City (at Universidad Autónoma Metropolitana, Unidad Xochimilco), I was awarded a scholarship by Field Projects International to attend a Tropical Biology and Primatology Field Course at the Los Amigos Biological Station in the Peruvian Amazon. I immediately fell in love with the rainforest and their research and promptly joined their team as a volunteer.

As the years went on, I became more involved in this research and received field and laboratory training. I started going to Peru as a field and lab manager, training research assistants in primate follows, sample collection and laboratory techniques. In 2018 I moved to Peru for five months to become senior manager of the first molecular field laboratory in the Amazon Rainforest, the Green Lab. Today, I am an Associate Research Scientist with FPI. 

Dr. Mrinalini Watsa and myself observing wildlife in Peru. Dra Mrinalini Watsa y yo observando vida silvestre en Peru. Photo credit: Ishaan Raghunandan.
Research interests
  • Conservation genomics
  • Field genomics
  • Non-invasive sampling
Inclusion statement - science is for everyone
It is my firm belief that everyone, regardless of age, gender, sexual orientation, race, cultural background, socio-economic status or ability deserves to be treated with dignity. I aim to always work toward inclusion in science, particularly for historically excluded minorities.

Publications


Parasite and microbiome comparisons between captive and wild primates (In prep)


G. Erkenswick, M. Watsa, A. Pomerantz, D. J. Park, S. Cave, A. Schmitt, D. Rudin, A. Viñas-Martínez, M. Paz-Mendoza, J. Chen, Y. Khadpekar, N.W. Pilfold, S. López-Clinton, M. McElroy, J. Brack, D. Dainko, S. Prost



Population assessment and strategies for the conservation of Nancy Ma's nights monkey populations at the Colombian-Peruvian Amazon border (In prep)


A. Maldonado, A. Peralta-Aguilar, I. Soto-Calderón, G. Inga-Díaz, A. Moreno, M. Watsa, G. Erkenswick, N. Sánchez, S. López-Clinton, L. M. Linares-Rosales


Owl Monkeys: Evolution, Behavioural Ecology and Conservation, E. Fernández-Duque, chapter 20, Springer


Implications of deforestation and the trade for biomedical research on the health status of Aotus nancymae at the Colombian-Peruvian Amazonian border (In prep)


A. P. Peralta-Aguilar, A. Maldonado, G. Erkenswick, M. Watsa, G. Inga-Díaz, S. López-Clinton, L. M. Linares-Rosales



Madre de Dios botanical DNA barcode reference library (In prep)


V. Swamey, M. Watsa, G. Erkenswick, S. López-Clinton, D. Coayla, M. Paz-Mendoza



In situ population genetics: A primer on Peruvian tamarins via ddRADSeq on a MinION sequencer (In prep)


M. Watsa, G. Erkenswick, A. Pomerantz, J. Chen, Y. Khadpekar, N. W. Pilfold, S. López-Clinton, A. Viñas-Martínez, D. Rudin, M. McElroy, A. Schmitt, M. Paz, J. Brack, D. Dainko, D. J. Park, S. Cave, S. Prost



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Projects


In situ genotyping of tamarins in southeastern Peru


Developing an genotyping tool for individual identification of saddleback and emperor tamarins using non-invasive samples and the MinION portable sequencer.


Science communication - Talks


Science communication talks on DNA, primates and life in the field.


Science communication - Foldscope workshops


Explorers of the Microcosmos - self designed and imparted workshops on microorganisms and microscopy using Foldscopes.


Tamarin colour vision


Behavioural and genetic research on colour vision polymorphisms of saddleback and emperor tamarins.


Field genomics in the Amazon Rainforest


Using field friendly and low-cost molecular technologies in Madre de Dios, Peru.

Acerca de


¡Hola!

Mi nombre es Samantha (mis pronombres son ella/la) y soy estudiante de la maestría en Biología Evolutiva en la Universidad de Upsala, Suecia, donde formo parte del grupo de investigación de la profesora Katerina Guschanski. Actualmente estoy desarrollando una herramienta de genotipado in situ para identificar individuos de pichicos común y emperador usando muestras no-invasivas y el secuenciador portable MinION. El proyecto es supervisado por la Dra. Guschanski y la Dra. Mrinalini Watsa.

En el 2015, mientras estudiaba la licenciatura de Biología en la Ciudad de México (en la Universidad Autónoma Metropolitana, Unidad Xochimilco), gané una beca de Field Projects International para un curso de Biología Tropical y Primatología en la Estación Biológica Río Los Amigos en la Amazonía peruana. Me enamoré de inmediato con la selva y la investigación que se hacía ahí y me uní al equipo de FPI como voluntaria.

Con el paso de los años me involucré más y más en los projectos de investigación y recibí entrenamiento de campo y laboratorio. Empezé a viajar a Perú como manager de campo y laboratorio, donde entrenaba asistentes en seguimiento de primates, colecta de muestras y técnicas de laboratorio. En el 2018 me mudé a Peru durante cinco meses para ser la principal encargada del primer laboratorio molecular de campo en la selva Amazónica, el Green Lab. Hoy en día soy Investigadora Asociada de FPI.
Photo credit: Ishaan Raghunandan.
Intereses de investigación
  • Genómica aplicada a la conservación
  • Genómica de campo
  • Muestreos no-invasivos
Declaración de inclusión - la ciencia es para todxs

Creo firmemente que todxs, sin importar edad, género, orientación sexual, raza, contexto cultural, estatus socio-económico o habilidad merecen ser tratadx con dignidad. Siempre intento trabajar por la inclusión en la ciencia, particularmente para minorías históricamente excluidas.

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